天天讯息：一项新研究确定了与最具侵略性的肾癌有关的基因

来源：cnBeta 　2023-01-07 05:36:21

研究人员发现，某些癌细胞表达的基因负责血液凝固，这有可能成为癌症治疗中抗凝血剂的目标。来自HSE的研究人员发现了对最具侵略性的透明细胞肾癌亚型具有特殊意义的基因。HSE计算机科学系国际生物信息学实验室的研究员Grigory Puzanov分析了456名该疾病患者的数据，并确定了预后有利或不利的癌症亚型。该研究结果发表在《科学报告》杂志上。

【资料图】

透明细胞肾癌（CCRC）是肾癌的一种类型，其特点是肿瘤中存在透明细胞。它是成年人中最常见的肾癌类型，约占所有肾癌的70-80%。CCRC倾向于快速生长和扩散，它往往在后期被诊断，因为它已经扩散到身体的其他部位。

在过去的几十年里，CCRC新病例的数量一直在增加。虽然有大量关于这种疾病的数据，但仍然缺乏可以帮助预测其临床过程的特定人类基因的信息。

Puzanov的研究结果揭示了哪些ccRCC亚型比其他亚型更危险，哪些人类基因似乎应该对该疾病的进展负责。这一新信息对于早期发现侵袭性肿瘤和为ccRCC患者设计个性化治疗方案具有重要意义。

作者分析了来自The Cancer Genome Atlas（TCGA）的456个肿瘤样本的数据，这些样本没有进行放疗或额外的药物治疗。使用k-means方法将样本聚类为具有类似特征的亚组，确定了具有不同生存率的亚型。对于基因聚类，Puzanov选择了2000个在ccRCC中表达模式高度可变的基因。

基因表达是一个基因被读取和复制以产生信使RNA（mRNA）的过程，然后用于合成蛋白质。

研究人员便携的一个生物信息学算法运行了100次，每次都是根据2000个基因的表达模式的相似性对肿瘤样本进行分类。三个具有不同生存率的集群（亚型）被识别出来。存活率最低的集群与转移和对后续治疗反应最差有关。

该研究分几个阶段进行。在第一阶段，为了更好地了解可能影响疾病进程的遗传因素，对每个集群的特征进行了研究。然后，研究作者确定了高生存率和低生存率集群所特有的关键基因，并为其合成由这些基因编码的蛋白质构建了一个相互作用的网络。

Puzanov的分析确定了哪些基因编码的蛋白质具有最高的网络连接数。发现存活率最差的集群与MFI2、CP、APOB和ENAM基因有关，这些基因已知参与胰岛素样生长因子（一种与胰岛素结构相似的蛋白质）的运输和蛋白质的翻译后修饰。此外，低存活率亚型特有的是编码与血液凝固有关的纤维蛋白原和凝血酶原的基因（FGA、FGG和F2）。

"这些关键基因中的一些可能会影响抗肿瘤疗法的疗效。例如，CP、FGA和FGG基因的活性增加与尼沃鲁单抗的不良反应有关，而APOB和ENAM的高表达则预测对舒尼替尼缺乏反应。这些知识可以帮助为恶性肿瘤患者开出最合适的靶向治疗处方"，HSE大学计算机科学系生物信息学国际实验室研究员Grigory Puzanov这样表示。

据该研究人员称，联合使用常规抗肿瘤药物和抗凝剂（有助于防止血栓的药物）可以提高癌症治疗的效果。因此，有证据表明，常用于治疗癌症患者血栓栓塞事件的肝素有助于患者的生存，并具有抗转移的活性。

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